Экспрессия промотора гена MMTV

Ретровирус MMTV

Регуляция промотора гена MMTV

Индукция вирусом MMTV злокачественной трансформации клеток

Литература

Геном ретровируса MMTV (Mouse mammary tumor virus) представлен одноцепочечной РНК, которая реплицируется в виде промежуточной двухцепочечной ДНК. В каждом вирионе упакованы две копии РНК. Последовательность ретровируса содержит три «гена» - кодирующие области, каждая из которых дает начало множеству белков в ходе процессинга. Порядок генов, gag—pol—env, приведен на рис. 1. Вирусная РНК транслируется как обычная информационная РНК (она содержит кэп на 5'-конце и poly(A) на З'-конце) в полибелке Gag.

Рис. 1. Структура вируса лейкемии мыши. gag — ген, кодирующий белок капсиды вируса; pol — ген обратной транскриптазы; env - ген, кодирующий гликопротеиновую оболочку вируса.

Ген gag дает начало белковым компонентам нуклеопротеинового ядра вириона. Одна из информационных РНК, в результате сплайсинга утративающая терминирующий кодон в гене gag, транслируется с образованием белка Gag—Pol. Сплайсинг также способствует образованию более коротких субгеномных информационных РНК, которые при трансляции образуют полипротеин Env, предшественник двух белков. Ген env кодирует компоненты вирусной оболочки, которая захватывает также компоненты клеточной цитоплазматической мембраны. Ген pol кодирует фермент, получивший название обратной транскриптазы, который состоит из двух субъединиц. Одна из субъединиц представляет собой образующийся при процессинге фрагмент другой субъединицы. Фермент осуществляет превращение РНК-генома в комплементарную цепь ДНК. Он катализирует также последующие стадии при образовании двухцепочечной ДНК, обладает ДНК-полимеразной активностью, ведет себя подобно РНКазе Н (способен деградировать РНК, входящую в состав гибрида РНК—ДНК) и обладает эндонуклеазной активностью.

Обратная транскриптаза упаковывается вместе с геномом в вирусную частицу. Фермент превращает РНК в линейную двухцепочечную молекулу ДНК в цитоплазме инфицированной клетки. Эта ДНК самостоятельно проникает в ядро, где она превращается в кольцевую молекулу. Одна или несколько копий ДНК интегрируют в геном хозяина. Интегрированная провирусная ДНК транскрибируется аппаратом хозяина с образованием вирусных РНК, которые затем используются как в качестве мРНК, так и в качестве геномов для упаковки в вирионы. Интеграция представляет собой нормальный этап жизненного цикла вируса и необходима для транскрипции.

Рис. 2. Особенности организации длинных концевых повторов (LTR) у ретровирусов.

Вирусная РНК содержит прямые повторы на концах. В различных штаммах вируса длина таких R-сегментов варьирует от 10 до 80 нуклеотидов. Рядом с R-сегментом в 5'-конце вирусного генома находится область U5, состоящая из 80-100 нуклеотидов. Ее название свидетельствует о локализации этой последовательности на 5'-конце. В З'-конце R-сегменту предшествует уникальный сегмент U3, содержащий 170-1250 нуклеотидов.[Надо вставить конкретные цифры для LTR MMTV]

Концы линейной ДНК содержат дополнительные последовательности. Сегмент U3 добавляется к 5'-концу; сегмент U5 - к З'-концу. В результате каждый конец ДНК имеет последовательность U5—R—U3; она получила название длинного концевого повтора (LTR). Ее образование связано с тем, что обратная транскриптаза переключает матрицы, перенося образующуюся ДНК на новую матрицу. На рисунке 3 показано образование одного LTR; для образования повтора на другом конце требуется подобное событие. Характерная черта вирусного генома - идентичность LTR, находящихся на его концах. Это объясняется их происхождением. З'-конец U5 состоит из короткого инвертированного повтора, родственного 5'-концу последовательности U3, в результате чего сама последовательность LTR фланкирована короткими инвертированными повторами.

Рис. 3. Последовательности LTR образуются при переключении матриц во время обратной транскрипции. Новая матрица может быть другим концом той же молекулы (как показано на рисунке) или другой молекулой.

Вирусная ДНК встраивается в случайные сайты генома клетки-хозяина. Инфицированная клетка содержит от одной до десяти копий провируса. В каждом сайте внедрения образуются короткие прямые повторы ДНК мишени. Их длина у MMTV равна ... парам оснований. Наличие прямых повторов свидетельствует о том, что механизм интеграции включает образование ступенчатых разрезов в ДНК хозяина, аналогичных тем, которые образуются при бактериальной транспозиции. Сайт интеграции специфичен в отношении вируса, и интегрированная ДНК отличается от неинтегрированной двумя парами оснований в каждом конце. Таким образом, интегрированная вирусная ДНК утрачивает две пары оснований в левом конце 5'-концевой последовательности U3 и две пары оснований в правом конце З'-концевой последовательности U5. [Надо вставить конкретные цифры для LTR MMTV]

Область U3 каждого LTR несет промотор. Промотор в левом LTR ответствен за инициацию транскрипции провируса. Иногда (довольно редко) промотор в правом LTR способствует транскрипции последовательности хозяина, прилегающей к сайту внедрения. Интеграция генома ретровируса может обусловливать опухолевую трансформацию клеток путем активации определенных типов клеточных генов.

Одним из наиболее значительных открытий последних лет является установление трехмерной структуры специфических комплексов репрессоров и активаторов транскрипции (трансрипционных факторов) c ДНК, в том числе и комплексов стероидных рецепторов с ДНК. Факторы транскрипции имеют модульное строение. Они содержат ДНК-связывающий домен и активирующий или репрессирующий домены, которые участвуют в активации или репрессии транскрипции за счет взаимодействия c другими транскрипционными факторами и белками холофермента - РНК полимеразы II, осуществлящей транскрипцию большинства эукариотических генов. Стероидные рецепторы, в отличие от других активаторов транскрипции, содержат еще домен, c которым связывается стероидный гормон.

Длинный концевой повтор (LTR) вируса MMTV имеет длину 1.2 т.п.н. На нём имеются места преимущественного связывания шести нуклеосом, которые обычно нумеруются от A до F. На рисунке показана позиция нуклеосомы B:

Экспрессия гена MMTV регулируется транскрипционными факторами, способными взаимодействовать ДНК-сайтами в составе нуклеосомы. Промотор гена содержит кластер из пяти мест связывания глюкокортикоидного рецептора, называемыми глюкокортикоидчувствительными элементами (GREs) и места связывания димеров ядерного фактора NF1 и октамер-связывающего фактора (Oct1). Наибольшая активация транскрипции возможна только в случае, если ДНК изогнута на поверхности нуклеосомы. Если нуклеосомная укладка отсутствует, то транскрипционные факторы GR и NF1 конкурируют друг с другом за связывание на близко расположенных сайтах. Если нуклеосомная укладка имеет место, GR и NF1 одновременно связываются с ДНК, что способствует наибольшей активации транскрипции. Связывание GR с сайтами, расположенными на поверхности нуклеосомы, приводит к определенным изменениям структуры нуклеосомы, обеспечивающим связывание фактора NF-1. Следовательно, наличие данной нуклеосомы, абсолютно необходимо для функционирования промотора MMTV - нуклеосома обеспечивает возможность одновременного взаимодействия с ДНК всех транс-активаторных белков, участвующих в индукции транскрипции MMTV под действием глюкокортикоидов.

Индукция гормоном глюкокортикоидного рецептора приводит к появлению в области нуклеосомы В гиперчувствительных мест расщепления ДНКазой и рестриктазами - нуклеосама переходит в ''открытую'' форму, оставаясь тем не менее на том же месте на ДНК. Удаление глюкокортикоидного рецептора из промотора добавлением антагонистов гормона приводит к ''закрытию'' хроматина. Для объяснения этого рассматривалось несколько механизмов. Одна из возможностей - вытеснение рецептором линкерного нистона H1. Другая возможность - ацетилирование гистонов. С другой стороны, изменения хроматина в области промотора могут вызываться и взаимодействием глюкокортикоидного рецептора в другими факторами. участвующими в активации этого промотора.

Стероидные гормоны - один из главных классов гормональных соединений всех видов позвоночных и многих видов беспозвоночных животных. Они являются регуляторами фундаментальных процессов жизнедеятельности многоклеточного организма - координированного роста, дифференцировки, размножения, адаптации, поведения [Хартман Э., 1972]. Глюкокортикоидный рецептор являеся промежуточным звеном, связывающим гормоны и после этого усиливающим или подавляющим генную экспрессию и процессы передачи сигналов между клетками и гомеостазиса. Действие рецептора зависит от контекста данного промотора и от текущего состояния клетки.

Действие стероидных гормонов на клетки-мишени осуществляется, главным образом, на уровне регуляции транскрипции генов. Оно опосредуется образованием комплекса гормона со специфическим регуляторным белком - рецептором, узнающим определенные участки ДНК в генах, регулируемых данным гормоном. Таким образом, рецепторы всех стероидных гормонов - лиганд-зависимые факторы транскрипции. Для них характерно значительное сходство аминокислотных последовательностей, идентичная доменная структура и сходный механизм действия. Вместе с близкими им рецепторами тиреоидных гормонов они объединяются в семейство рецепторов стероидных/тиреоидных гормонов, которое входит в более обширное надсемейство регуляторных белков - ядерных рецепторов [Mangelsford D.J. et al., 1995].

Стероидные гормоны синтезируются из холестерина, в основном, в коре надпочечников, тестикулах, яичниках и плаценте; однако, каждая ткань, продуцирующая стероиды, имеет свой собственный характерный профиль продуктов секреции. Стероидные соединения плохо растворяются в воде и хорошо в органических растворителях и растительных маслах. Все стероидные гормоны благодаря липофильности относительно легко проникают через плазматические липопротеидные мембраны и поэтому могут свободно секретироваться клетками стероидогенных эндокринных желез и входить внутрь реагирующих клеток.

У человека глюкокортикоиды, связываясь с глюкокортикоидными рецепторами, вызывают чрезвычайно разнообразные биологические эффекты. Эти рецепторы связываются на ДНК с GRE-элементами, расположенными в промоторных областях генов-мишеней и регулируют их транскрипционную активность. кроме того, эти рецепторы взаимодействуют с другими транскрипционными факторами посредством белок-белковых взаимодействий и взаимно репрессируют или стимулируют друг друга в транскрипционной активности других генов. Последняя роль глюкокортикоидных рецепторов может быть даже важнее первой, позволяя выживать и производить потомство мышам, у которых содержатся мутантные рецепторы, активные в отношении белок-белковых взаимодействий, но неактивные в связывании с ДНК, тогда как мыши с делецией всего рецепторного гена умирают сразу после рождения.

Глюкокортикоидный рецептор связывается в широкой бороздке ДНК в форме димера. Консенсусная последовательность GR, выведенная в результате сравнительного анализа их первичной структуры, представляет собой несовершенный инвертированный повтор GGTACAnnnTGTTCT [Beato M., Chalepakis G, Schauer M., Slater E.P. // J. Steroid. Biochem. 1989. V. 32. P. 737-748. ]. Здесь заглавными буквами выделены последовательности, с которыми связываются два мономера глюкокортикоидного рецептора. Составляющие повтор гексануклеотиды разделены спейсером из трех пар нуклеотидов. При этом правая часть повтора - гексануклеотид TGTTCT - гораздо более консервативна, чем левая [Beato M. et al. 1989, Seledsov I.A. et al. 1991].

В MMTV промоторе глюкокортикоидный рецептор образует прочный комплекс с участком ДНК с последовательностью 5'-GTTACAaacTGTTCTtaaaag-3'. Согласно данным рентгеноструктурного анализа для комплекса глюкокортикоидного рецептора c ДНК [P.B. Sigler et al. Nature v. 352, 497-505, 1991] фосфатная группа гуанина, играет важную роль в стабилизации комплекса глюкокортикоидного рецептора с ДНК. Этот остаток гуанина подчеркнут в последовательности, приведенной выше.

Известные сайты связывания рецепторов таких стероидных гормонов, как прогестины, минералокортикоиды, андрогены, гомологичны консенсусной последовательности GR, которая в искусственных конструкциях способна обеспечивать активацию транскрипции под действием этих гормонов [Truss M. et al., 1993]. Показано, что GR в длинном концевом повторе MMTV ответственны также и за индукцию генов этого провируса прогестероном, поэтому эти элементы часто называют HRE. Способность группы рецепторов стероидных гормонов узнавать одни и те же регуляторные элементы в ДНК определяется большим сходством их ДНК-связывающих доменов [Mangelsford D.J. et al., 1995].

Известно, что встроенные непосредственно перед гетерологичным промотором и репортерным геном фрагменты ДНК, соответствующие "классическому" консенсусу GR, способны функционировать как GR в искусственных конструкциях [Strahle U. et al., 1988, Slater E.P. et al., 1985, Rhodes C. et al., 1995]. Остается неясным, могут ли такие одиночные GR сами по себе обеспечивать индукцию природных генов глюкокортикоидами [Lucas P.C. et al., 1992]. Так, например, показано, что GR из энхансера гена ТАТ крысы, встроенный вблизи промотора на расстоянии 351 п.н. выше старта транскрипции этого гена, не может опосредовать гормональную индукцию. Чувствительность к гормонам в этом случае появлялась только после встраивания вблизи GR дополнительных регуляторных элементов: второго GR, сайтов связывания транскрипционных факторов NF-1 или SP1 , либо СААТ-бокса [Strahle U. et al., 1988].

Глюкокортикоидный рецептор состоит из трёх функциональных и структурных доменов: N-концевого модуляторного домена, ДНК-связывающего домена и гормонсвязывающего домена [Simons, S.S. et al. 1995].

N-концевой домен включает примерно 439 аминокислот в начальной последовательности белка и отвечает в основном за активацию транскрипции. ДНК-связывающий домен длиной примерно 65 аминокислот занимает центральную позицию. Его функции - специфическое связывание с ДНК, гомодемиризация и взаимодействие с другими белками. Домен, связывающий гормон, находится в С-концевой части белка и состоит приблизительно из 250 аминокислот. Этот домен контролирует общую актовность рецептора, выключая её при связывании с белками теплового шока и циклофилинами, и включая, при взаимодействии с гормоном и коактиваторами. [Обзор стероидных рецепторов: Tsai, Ming-Jer and Bert O'Malley (1994); Beato, M. et al. 1995.]

Для анализа гомологии глюкокортикоидного рецептора с другими белками его удобнее разделить на пять гомологичных доменов. N-концевой домен уникален для глюкокортикоидного рецептора по структуре и функции соответствует структурному домену. Центральный домен является общим для всех членов субсемейства рецепторов retinoic кислоты, тироидных и стероидных гормонов и соответствует упомянутому выше днк-связывающему структурному домену.

В С-концевой части белка находятся три гомологичных домена. Из них N-концевой и центральный домены содержатся в рецепторных белках ретиноевой кислоты, тироидов и стероидов. С-концевой домен содержитс в андрогенных, глюкокортикоидных и прогестероновых рецепторах стероидного субсемейства. Все эти три гомологичных домена соответствуют одному вывшеописанному связывающему гормон структурному домену.

Глюкокортикоидные рецепторы присутствуют в клетках в виде нескольких изоформ. У человека множественные изоформы hGR генерируются из единичного hGR гена мутациями и/или полиморфизмом, альтернативним сплайсингом транскриптов и альтернативной инициацией транскрипции. Каждая эта изоформа, в свою очередь, подвергается после трансляции различным модификациям, которые влияют на функцию рецептора. Сбои в работе этих механизмов вызывают различные заболевания человека. [Ann N Y Acad Sci. 2004 Jun;1024:102-23. The origin and functions of multiple human glucocorticoid receptor isoforms. Lu N.Z. Cidlowski J.A.]

Первичный транскрипт hGR гена при альтернативном сплайсинге приводит к трансляции a-hGR и b-hGR изоформ. Предполагалось, что активация и репрессия генов осуществляется a-hGR, тогда как b-hGR может играть роль в ингибировании вызываемой a-hGR активации, но в работе [Mol Cell Endocrinol. 1999 Nov 25;157(1-2):95-104. Interaction of glucocorticoid receptor isoforms with transcription factors AP-1 and NF-kappaB: lack of effect of glucocorticoid receptor beta. Brogan IJ, Murray IA, Cerillo G, Needham M, White A, Davis JR.] это не подтвердилось. g-Изоформа глюкокортикоидного рецептора человека - g-hGR - отличается от главной a-hGR формы белка присутствием одной дополнительной аминокислоты в ДНК-связывающем домене. Это может уменьшать активацию транскрипции.

В ответ на индукцию гормоном глюкокортикоидный рецептор (GR) фосфорилируется по нескольким сериновым остаткам. Предполагается, что фосфорилирование GR включает механизм его транспорта в ядро клетки и, возможно, регулирует его транскрипционную активность. [Modulation of Glucocorticoid Receptor Function via Phosphorylation Ann. N.Y. Acad. Sci. 1024: 86-101 (2004). NAIMA ISMAILIa and MICHAEL J. GARABEDIANa,b ]

Ядерные факторы NF1 регулируют экспрессию многих клеточных и вирусных генов. Они участвует в экспрессии многих как тканеспецифичных генов, так и генов, регулирующих дифференцировку клеток. Анализ последовательностей из разных видов показал показал наличие семейства из четырёх генов (NFI-A NFI-B NFI-C, и NFI-X) структура которых высококонсервативна у позвоночных от циплёнка до человека.

Белки NF1 содержат высококонсервативный, но генспецифичный N-концевой домен из 200 аминокислот, который определяет связывание с ДНК, димеризацию и инициацию репликации. Белки NF1 связываются с ДНК как в виде гомо-, так и гетеродимеров и узнают связывающие места с консенсусной последовательностью TTGGCNNNNNGCCAA. C-концевые домены белков NF1 вариабельны и содержат различные домены, моделирующие транскрипцию. Дополнительная вариация наблюдается из-за разного сплайсинга транскриптов у каждого из этих четырёх генов. Белки NF1 могут выступать как активаторы, так и репрессоры транскрипции. Так, например, изоформа NF-1С человека взаимодействует с С-концевым гептапептидным повтором (CTD) РНК-полимеразы II, активируя транскрипцию.

Промотор гена MMTV включает сайт связывания NF-1. Связывание NF-1 с данным районом необходимо для гормональной индукции, причем in vivo, когда ДНК провируса ММТV находится в составе хроматина, связывание NF-1 происходит только в ответ на введение гормона [Ali Z.Chaudhry et al., 1999]. С другой стороны, было показано, что на ДНК промотора MMTV без нуклеосомы GR и NF-1 конкурируют за связывание с узнаваемыми ими расположенными рядом друг с другом сайтами. В результате точной укладки ДНК промоторного района ММТV на поверхности гистонового октамера HRE становятся доступны для GR, тогда как сайт связывания NF-1 недоступен для соответствующго фактора.

Таким образом, активыация промотора MMTV включпет двухступенчатый синергизм: сначала гормональный рецептор связывается с двумя доступными HRE сайтами на нуклеосоме, вызывая ремодуляцию хроматина, открывающими доступ к местам связывания фактора FN1. В свою очередь связанный FN1 стабилизирует открытую нуклеосомную конформацию, позволяющую связаться с закрытыми ранее сайтами другие молекулы рецептора и полностью активировать промотор. [Di Croce et. al., 1999]

Основной единицей эвкариотического хроматина является нуклеосома, которая состоит из кора гистонового октамера, вокруг которого наматывается левозакрученная сверхспиральная ДНК длиной 147 пар оснований, которая делает при этом 1,65 оборота вокруг нуклеосомы. Цепь нуклеосом соединяется линкерной ДНК длиной 20-30 пар оснований, образуя 10 нанометровую фибриллу, которая в интерфазном ядре далее компактизуется в менее регулярную 30 нанометровую фибриллу, которые стабилизируется взаимодействиями между нуклеосомами так называемыми линкерными гистонами, например H1, H5 и другими.

Нуклеосомы располагаются на ДНК не случайным образом. Их положение определяется вариациями определённых нулеотидных последовательностей, которые приводят к структурным изменениям параметров двойной спирали, облегчающим её наматывание на нуклеосому. Эти параметры включают анизотропию изгибаемости спирали ДНК в сторону большого и малого желобов, естественной кривизной спирали, незгибаемостью некоторых последовательностей и повторами триплета CTG. Наиболее полно изучено возникновение естественной кривизны спирали с периодом 10 пар нуклеотидов, вызванное сужением малого жёлоба ДНК из-за присутствия AT пар и его расширения из-за увеличенного числа GC пар оснований. При наматывании на гистоновый октамер суженный жёлоб направлен к нуклеосоме, а расширенный - наружу. [J. Wong et al. 1997]

Связывание гистона Н1 стабилизирует нуклеосому и защищает линкерный участок между гистонами от расщепления микрококовой нуклеазой. Взаимодействие между нистонами Н1 нуклеосом разных фибрилл компактизует их с образованием структур хроматина более высоких порядков, подавляя тем самым транскрипционную активность большинства промоторных участков ДНК. Тем не менее в последние годы была обнаружена и другая роль нистона Н1 в регуляции транскрипции: в некторых случаях этот гистон может участвовать в активации промотора, происходящей без нарушения нуклеосомной органиации хроматина.

Было показано [Ronald Koop et al., 2003], что введение гистона Н1 в минихромосому MMTV компактизует структуру хроматина и уменьшает фоновую транскрипцию с промотора как в отсутствии специфических факторов, так и в присутствии только GR или только NF1. Тем не менее, гистон Н1, присоединённый к гистоновому октамеру, усиливает транскрипцию если присутствуют оба фактора. Механизм такого синергизма заключается в том, что связывание гистона Н1 облегчает свзявание GR на внешних сайтах, но уменьшает их связывания с внутренними сайтами. После свзявания NF1 к такому комплексу конформация нуклеосомы изменяется и внутренние места становятся доступными для свзывания в ещё двумя молекулами GR, что делает этот промотор ''открытым'' для начала транскрипции. Авторы предполагают, что связывание GR индуцирует фосфорилирование гистона Н1 линкерной гистоновой киназой, а также связывание в этом месте нуклеосомного ремодулирующего фактора (NURF), эти два события приводят к удалению гистона H1 и делают промотор полностью открытым для транскрипции. [Di Croce et.al., 1999]

Продемонстрирована ассоциация с Т-клеточными лимфомами и вируса MMTV (Dudley, Risser, 1984 ; Ball et al., 1988). При этом в лимфомах выявляется множество приобретенных (амплификация) провирусов MMTV , которые имеют нарушения в своей структуре (делеции в LTR , в гене env) (Hsu et al., 1988 ; Racevskis, 1990). Авторами было предположено, что за счет мутаций в геноме вируса убирается действие негативной регуляции. В дальнейшем это предположение не нашло полного подтверждение в работе на трансгенных животных, хотя наличие негативного регуляторного элемента в LTR MMTV было показано. Кроме того показано, что в некоторых линиях лимфомных Т-клеток мыши действуют специфические механизмы, которые изменяют продукты транскрипции MMTV (в них возникают делеции, возможна преждевременная терминация) (Racevskis, 1990). В одной из таких линий (EL-4) выявлена перестройка бета-цепи рецептора интерлейкина 2, произошедшая в результате инсерции в него LTR интрацистернальной А-частицы (Kono et al., 1990). Инсерционная мутация привела к конститутивному синтезу IL-2Rбета , что, по мнению авторов, могло стать причиной возникновения лимфомы. В этой связи интересно отметить, что трансактиватор HTLV -1 (ген tax) активирует у трансгенных мышей ген IL-2Rбета ( Green et al., 1989 ), а gp120 HIV -1 ингибирует мРНК интерлейкина 2 ( Oyaizu et al., 1990 ). Поскольку при инфицировании HIV и SIV часто наблюдаются лимфомы, можно думать, что здесь есть определенная взаимосвязь. В общем плане на это указывают и данные, свидетельствующие о изменении экспрессии цитокиновых генов при HIV -инфекции ( D'Addario et al., 1990 ). Имеются также данные, указывающие на участие IL-2Rбета в злокачественной трансформации клеток ( Allouche et al., 1989 ).

------------------------------------------------------

Литература:

Б.Льюин. Гены. Глава 29. Нуклеосомные частицы и структура хроматина.

Б.Льюин. Гены. Глава 30. Нуклеосомы в активном хроматине.

Б.Льюин. Гены. Глава 36. Транспозирующиеся элементы бактерий.

Б.Льюин. Гены. Глава 37. Мобильные элементы эукариот.

Б.Льюин. Гены. Глава 38. Элементы, способные к перемещению в пределах генома и вне его.

Основы онкогенетики. Глава 20. (PDF-файл)

Nuclear receptor cofactors as chromatin remodelers. Bryan D Lemon, Leonard P Freedman. Current Opinion in Genetics & Development 1999, 9:499-504.

Belikov S., Gelius, B., and Wrange W. Hormone-induced nucleosome positioning in the MMTV promoter is reversible // EMBO J. 2001. 20, 2802-2811. - (Medline)

Belikov, S., B. Gelius, G. Almouzni, and O. Wrange. 2000. Hormone activation induces nucleosome positioning in vivo. EMBO J. 19:1023–1033. (PDF-файл)

Sergey Belikov, Carolina Astrand, Per-Henrik Holmqvist, and Orjan Wrange. Chromatin-Mediated Restriction of Nuclear Factor 1/CTF Binding in a Repressed and Hormone-Activated Promoter In Vivo. Mol Cell Biol. 2004 April; 24 (7): 3036–3047 (PDF-файл)

Консенсусная последовательность GRE.

Гормоны стероидные: общие сведения.

abstracts статей по годам.

--------------

.

Мутация белка Нох и макроэволюция строения тела насекомых: Майк Левин. Как насекомые теряют конечности.

William d. Pennie, gordon l. Hager, and catharine l. Smith Molecular and cellular biology, apr. 1995, p. 2125–2134 vol. 15, no. 4 [Найти ссылку на PDF-файл] ------------------------------------------

Ali Z.Chaudhry, Alfredo D.Vitullo,and Richard M.Gronostajski. Nuclear Factor I-mediated Repression of the Mouse Mammary Tumor Virus Promoter Is Abrogated by the Coactivators p300/CBP and SRC-1. THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY Vol.274, No.11, IssueofMarch 12, pp.7072–7081, 1999 (7072.pdf)

Carlstedt-Duke, J., et al. Domain structure of the glucocorticoid receptor protein. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 4437-4440 (1987) 4437.pdf

Tsai M.J., O'Malley B.W. Molecular mechanisms of action of steroid/thyroid receptor superfamily members. Annu Rev Biochem. 1994;63:451-86.

Ronald Koop, Luciano Di Croce and Miguel Beato. Histone H1 enhances synergistic activation of the MMTV promoter in chromatin. The EMBO Journal Vol. 22 No. 3 pp. 588-599, 2003. 588.pdf

J. Wong, Qiao Li, Ben-Zion Levi, Yun-Bo Shi and Alan P.Wolffe. Structural and functional features of a specific nucleosome containing a recognition element for the thyroid hormone receptor. The EMBO Journal Vol.16 No.23 pp.7130-7145, 1997 [7130.pdf]

M.H. Kim and D.O. Peterson. Oct-1 Protein Promotes Functional Transcription Complex Assembly on the Mouse Mammary Tumor Virus Promoter. J. OF BIOLOGICAL CHEMISTRY Vol.270, No.46,Issueof November17, pp.27823–27828, 1995. 27823.pdf

----------------

Работа финансируется по гранту РФФИ 04-04-49364: Гроховский С.Л. ''Низкомолекулярные репрессоры и активаторы транскрипции гормон-зависимых генов. ИМБ РАН.'' Москва.