Формат исходных файлов для каждого проанализированного геля (meNN) от софы (данные через строки или запятые):

1 - название геля: номер, число или номер геля (default.xxx)
2 - название последовательности
3 - число дорожек на геле (LANE)
4 - анализируемая дорожка без лиганда (LANEAN)
5 - число анализируемых полос (нуклеотидов) = SEQ1
6 - номер первого анализируемого нуклеотида с 5'-конца = SEQ2
7 - анализируемая дорожка с лигандом
8 - последовательность всего фрагмента с запятыми - в конце ноль
9 - данные SAFA для всех дорожек с запятыми и переводом строки после каждого нуклеотида.

Файлы meNN.txt - после обработки каждого файла NN окном в 31 нуклеотид - в начале файла повтор пунктов 1-9, только данные от софы соотнесены с анализируемой последовательностью, уменьшены в 100 раз и округлены до целого. Потом приведены данные для дорожек без и с Me: сначала максимальные и минимальные значения для этих двух дорожек, потом картинки относительных интенсивностей и значения для динуклеотидов этих дорожек.
В файлах SUM-ALL.TXT суммированы данные для всех динуклеотидов при данной концентрации Me