ഀ ഀ
ഀGelDroog - Программа анализа гелей
с ручной корректировкой треков㰀倀㸀㰀栀爀 猀椀稀攀㴀㐀 眀椀搀琀栀㴀㌀ ─㸀㰀栀㈀㸀㰀瀀 愀氀椀最渀㴀∀䌀䔀一吀䔀刀∀㸀ἀ䀄㔄㐄㼄㸄㬄〄㌄〄㔄㰄䬄㤄 㼀㸄䀄伄㐄㸄㨄 䀀〄㸄䈄䬄㨄㰀⼀栀㈀㸀㰀戀㸀ഀ
㰀瀀㸀 〄㸄䜄㠄㔄 䐀〄㤄㬄䬄 㼀䀄㸄㌄䀄〄㰄㰄䬄 䌀䄄䈄〄㴄〄㈄㬄㠄㈄〄丄䈄䄄伄 ㈀ 㴀㔄㨄㸄䈄㸄䀄䬄㤄 㨀〄䈄〄㬄㸄㌄⸄ഀ
㰀戀爀㸀␀〄㤄㬄䬄 㸀䀄〄㜄〄 ㌀㔄㬄㔄㤄 㨀㸄㼄㠄䀄䌄丄䈄䄄伄 ㈀ 㼀㸄㐄㨄〄䈄〄㬄㸄㌄ ഀ
㰀戀爀㸀ሀ㴄〄䜄〄㬄㔄 㼀㸄㬄䰄㜄㸄㈄〄䈄㔄㬄䰄 ㈀㈄㸄㐄㠄䈄 ⠀䀀㔄㌄㠄䄄䈄䀄㠄䀄䌄㔄䈄⤄ 㸀䀄〄㜄䬄 ㌀㔄㬄㔄㤄Ⰴ 㼀㸄㬄䰄㜄䌄伄䄄䰄 䄀㼄㔄䘄㠄〄㬄䰄㴄㸄㤄 䐀㸄䀄㰄㸄㤄 ㈀㈄㸄㐄〄⸄ ᐀㬄伄 㨀〄㘄㐄㸄㌄㸄 㸀䀄〄㜄〄 ㌀㔄㬄伄 ㈀㈄㸄㐄㠄䈄䄄伄㨄ഀ
㰀瀀㸀Ḁ㸄㜄㴄〄䜄㔄㴄㠄㔄 ⠀㠀㰄伄⤄ ㌀㔄㬄伄ഄ
Имя файла с образом - tif㰀戀爀㸀ᴀ〄㼄䀄〄㈄㬄㔄㴄㠄㔄 ⠀䄀㈄㔄䀄䔄䌄 ㈀㴄㠄㜄Ⰴ 䄀㴄㠄㜄䌄 ㈀㈄㔄䀄䔄Ⰴ 䄀㬄㔄㈄〄 㴀〄㼄䀄〄㈄㸄Ⰴ 䄀㼄䀄〄㈄〄 㴀〄㬄㔄㈄㸄⤄ഀ
Дата эксперимента - 1-11-05㰀戀爀㸀ἀ䀄㠄㰄㔄䜄〄㴄㠄㔄 ⴀ ᬀ丄㸄㔄Ⰴ 䄀㨄㸄㬄䰄 䌀㌄㸄㐄㴄㸄 㸄㬄䰄䠄㸄㔄 㼀䀄㠄㰄㔄䜄〄㴄㠄㔄ഄ
㰀瀀㸀᐀〄㬄㔄㔄 㼀㸄㬄䰄㜄㸄㈄〄䈄㔄㬄䰄 㐀㸄㬄㘄㔄㴄 ㈀㈄㔄䄄䈄㠄 ㈀ 〄㜄䌄 㐀〄㴄㴄䬄䔄 ㈀䄄㔄 㠀䄄㼄㸄㬄䰄㜄䌄㔄㰄䬄㔄 㼀㸄䄄㬄㔄㐄㸄㈄〄䈄㔄㬄䰄㴄㸄䄄䈄㠄 㴀䌄㨄㬄㔄㸄䈄㠄㐄㸄㈄⸄ ᐀㬄伄 㨀〄㘄㐄㸄㤄 㼀㸄䄄㬄㔄㐄㸄㈄〄䈄㔄㬄䰄㴄㸄䄄䈄㠄 ㈀㈄㸄㐄㠄䈄䄄伄㨄ഀ ഀ
Обозначение (имя) последовательности - ATAA㰀戀爀㸀℀㸄䄄䈄㈄㔄㴄㴄㸄 䈀㔄㨄䄄䈄 㼀㸄䄄㬄㔄㐄㸄㈄〄䈄㔄㬄䰄㴄㸄䄄䈄㠄 ⴀ ⠀㰀㸄㘄㴄㸄 ㈀㈄㸄㐄㠄䈄䰄 㠀㜄 䈀㔄㨄䄄䈄㸄㈄㸄㌄㸄 䐀〄㤄㬄〄⤄ഀ
Примечание - Любые дополнительные данныеഀ
Для анализа гелей пользователь выбирает пункт㰀㔄㴄丄 က㴄〄㬄㠄㜄묄⸀ഀ 㰀瀀㸀ἀ䀄㸄㌄䀄〄㰄㰄〄 㼀䀄㔄㐄㬄〄㌄〄㔄䈄 㜀〄䀄㔄㌄㠄䄄䈄䀄㠄䀄㸄㈄〄䈄䰄 㴀㸄㈄䬄㤄 㴄〄㬄㠄㜄㨄ഀ 㰀瀀㸀Ḁ㸄㜄㴄〄䜄㔄㴄㠄㔄 ⠀㠀㰄伄⤄ 㴄〄㬄㠄㜄〄 㬀丄㸄㔄 㨀䀄〄䈄㨄㸄㔄 㸀㸄㜄㴄〄䜄㔄㴄㠄㔄ഄ 㰀戀爀㸀ጀ㔄㬄䰄 ㈀䬄㠄䀄〄㔄䈄䄄伄 㠀㜄 䄀㼄㠄䄄㨄〄 䌀㘄㔄 ㈀㈄㔄㐄㔄㴄㴄䬄䔄 ㌀㔄㬄㔄㤄ഄ 㰀戀爀㸀ἀ㸄䄄㬄㔄㐄㸄㈄〄䈄㔄㬄䰄㴄㸄䄄䈄䰄ꀄ ㈀䬄㠄䀄〄㔄䈄䄄伄 㠀㜄 䄀㼄㠄䄄㨄〄 䌀㘄㔄 ㈀㈄㔄㐄㔄㴄㴄䬄䔄 ഀ 㰀戀爀㸀ἀ䀄㠄㰄㔄䜄〄㴄㠄㔄 ⴀꀀꀀꀀ ᬀ丄䬄㔄 㐀㸄㼄㸄㬄㴄㠄䈄㔄㬄䰄㴄䬄㔄 㐀〄㴄㴄䬄㔄ഄ ഀ
Тег для отбора результатов используется позднее для организации сложных выборок, вводить его на этом этапе не надо.ഀ
После регистрации нового анализа, открывается окно с образом геля.ഀ
ഀ
Правым кликом мыши пользователь может указать регион на образе геля, и он будет отображен в новом окне с 4-х кратным увеличением.ഀ 㰀瀀 愀氀椀最渀㴀∀䌀䔀一吀䔀刀∀㸀㰀䤀䴀䜀 匀刀䌀㴀∀㈀⸀樀瀀最∀ 圀䤀䐀吀䠀㴀㐀㈀㤀 䠀䔀䤀䜀䠀吀㴀㌀㈀㔀 嘀匀倀䄀䌀䔀㴀∀㔀∀ 䠀匀倀䄀䌀䔀㴀∀㌀ ∀ 䄀䰀吀㴀∀∀㸀ഀ ഀ
От пользователя требуется обозначить начало анализируемого участка. Установив курсор мыши на край нужной полоски на треке, пользователь должен нажать правый клик мыши и вести ее к другому концу полоски. После отпускания кнопки мыши координаты «ворот» будут введены. Кроме ширины и координат полоски программа также получает информацию о наклоне фронта полосок.ഀ
Появится окно, позволяющее пользователю указать, какой нуклеотид в последовательности соответствует только что указанным воротам. Пользователь может не указывать его, если он ввел это соответствие для первых ворот.ഀ
ഀ
Минимальное количество ворот на треке, естественно, два (начало и конец анализируемого участка). Пользователь может задать сколь угодно большое количество ворот на один трек, при сложной форме трека.ഀ
Ворота можно добавлять и удалять по желанию. После ввода всех нужных ворот можно запустить процесс анализа.ഀ
Программа анализирует трек, как совокупность многоугольников, от начальных «ворот» к конечным. Выдаются предупреждения о несоответствии нуклеотидов, назначенных в ворота.ഀ 㰀瀀㸀 㔄㜄䌄㬄䰄䈄〄䈄 㴄〄㬄㠄㜄〄 ㈀䬄㈄㸄㐄㠄䈄䄄伄 ㈀ ㈀㠄㐄㔄㨄ഀ ഀ
Номер и имя анализа㰀戀爀㸀⠀ᄀ㸄㬄䰄䠄〄伄 䈀〄㬄㠄䘄〄⤄ഀ
Позиция нуклеотида от начала㰀戀爀㸀᠀㴄䈄㔄㴄䄄㠄㈄㴄㸄䄄䈄䰄 㼀㸄㬄㸄䄄㨄㠄ഄ
㰀瀀㸀ⴀ䈄〄 䈀〄㬄㠄䘄〄 㰀㸄㘄㔄䈄 䬄䈄䰄 䴀㨄䄄㼄㸄䀄䈄㠄䀄㸄㈄〄㴄〄 ㈀ 䈀㔄㨄䄄䈄㸄㈄㸄㰄 ㈀㠄㐄㔄⸄ഀ
㰀瀀㸀Ḁ㐄㠄㴄 㴄〄㬄㠄㜄 ጀ†䴀䈄㸄 䀀㔄㜄䌄㬄䰄䈄〄䈄 㸀䀄〄㸄䈄㨄㠄 ḀᐄᴄḄጄḄ 䈀䀄㔄㨄〄⸄ഀ
㰀瀀 愀氀椀最渀㴀∀樀甀猀琀椀昀礀∀㸀ጀ㔄㬄䰄 㰀㸄㘄㔄䈄 㠀㰄㔄䈄䰄 㴀㔄䄄㨄㸄㬄䰄㨄㸄 㴄〄㬄㠄㜄㸄㈄Ⰴ 㔀䄄㬄㠄 䄀䈄〄䀄䬄㔄 㴄〄㬄㠄㜄䬄 䄀㸄䔄䀄〄㴄㔄㴄䬄 ㈀ 〄㜄㔄 㐀〄㴄㴄䬄䔄Ⰴ 㸀㴄㠄 ㈀㠄㐄㴄䬄 㴀〄 㠀㜄㸄䀄〄㘄㔄㴄㠄㠄 ㌀㔄㬄伄 㼀䀄㠄 ㈀㈄㸄㐄㔄 㴀㸄㈄㸄㌄㸄 ⠀䜀䈄㸄䬄 㴀㔄 㼀䌄䈄〄䈄䰄䄄伄Ⰴ 㨀〄㨄㸄㤄 䈀䀄㔄㨄 䌀㘄㔄 㸀䀄〄㸄䈄〄㴄Ⰴ 㨀〄㨄㸄㤄 㴀㔄䈄⤄⸀ഀ
㰀瀀 愀氀椀最渀㴀∀樀甀猀琀椀昀礀∀㸀ᰀ㸄㘄㴄㸄 㴄〄㬄㠄㜄㠄䀄㸄㈄〄䈄䰄 㸀㐄㠄㴄 㠀 䈀㸄䈄 㘀㔄 䈀䀄㔄㨄 䄀 䀀〄㜄㴄㸄㤄 䀀〄䄄䄄䈄〄㴄㸄㈄㨄㸄㤄 ㈀㸄䀄㸄䈄Ⰴ 㠀 䀀㔄㜄䌄㬄䰄䈄〄䈄䬄 䌄㐄䌄䈄 㜀〄㼄㠄䄄〄㴄䬄Ⰴ 㨀〄㨄 䀀〄㜄㴄䬄㔄 㴄〄㬄㠄㜄䬄⸄ഀ
㰀倀㸀㰀栀爀 猀椀稀攀㴀㐀 眀椀搀琀栀㴀㌀ ─㸀 㰀倀㸀㰀栀爀 猀椀稀攀㴀㐀 眀椀搀琀栀㴀㌀ ─㸀ഀ
㰀瀀㸀 〄㸄䈄〄 䐀㠄㴄〄㴄䄄㠄䀄䌄㔄䈄䄄伄 㼀㸄 ㌀䀄〄㴄䈄䌄 㰀愀 栀爀攀昀㴀∀栀琀琀瀀㨀⼀⼀眀眀眀⸀爀昀戀爀⸀爀甀⼀搀攀昀愀甀氀琀⸀愀猀瀀㼀搀漀挀开椀搀㴀㔀㜀㌀∀㸀 ␄␄᠄ 㐀ⴀ 㐀ⴀ㐀㤀㌀㘀㐀㰀⼀愀㸀㨀 ጀ䀄㸄䔄㸄㈄䄄㨄㠄㤄 ℀⸄ᬀ⸄ ✀✀ᴀ㠄㜄㨄㸄㰄㸄㬄㔄㨄䌄㬄伄䀄㴄䬄㔄 䀀㔄㼄䀄㔄䄄䄄㸄䀄䬄 㠀 㨄䈄㠄㈄〄䈄㸄䀄䬄 䈀䀄〄㴄䄄㨄䀄㠄㼄䘄㠄㠄 ㌀㸄䀄㰄㸄㴄ⴄ㜀〄㈄㠄䄄㠄㰄䬄䔄 ㌀㔄㴄㸄㈄⸄ ᠀ᰄᄄ ငᴄ⸄✀✀ ᰀ㸄䄄㨄㈄〄⸄ ഀ